Если смотреть глобально, то это камеры одного класса и, за исключением мелких деталей, очень похожи. Число пикселей матриц в расчет не берем, т.к. это спорный фактор, лучше 25 мегапикселей или 20. Т.к. у вас это, скорее всего, первая зеркальная фотокамера и багажа оптики нет, то совет — пойдите в фотосалон, где обе камеры можно подержать в руках, со своей флешкой и сделайте несколько тестовых снимков обеими камерами — один и тот же объект на широкий угол (18мм) при разных значениях ISO и в режиме теле (55 мм), поснимайте в помещении и через окно на улице, тоже при разных ISO (больше 6400 не поднимайте, т.к. более высокими редко кто пользуется). Желательно снимать в режиме RAW+Jpeg. Потом дома посмотрите что получилось, сравните цвета. RAW посмотрите в Lightroom (можно скачать тестовую версию с сайта Adobe). В итоге, снимки с какой камеры понравятся, ту и берите.
А по поводу, что лучше из систем Canon или Nikon, на сайте была статья, почитайте.
http://www.fotokomok.ru/sravnivaem-canon-i-nikon-chto-luchshe/
http://www.fotokomok.ru/canon-ili-nikon-chast-ii-reportazhnye-i-professionalnye-kamery/